احتمال بروز سرطان‌های ثانویه در پی درمان‌ با CAR-T ⚖️سازمان غذا و دارو آمریکا هشداری در مورد خطر ابتلا به سرطان های ثانویه در بیماران سرطانی تحت درمان با سلول درمانی CAR-T صادر کرده است. این اخطار از تولیدکنندگان می‌خواهد که یک «جعبه اخطار» را به اطلاعات تجویز محصولات اضافه کنند. این سازمان 25 گزارش از بدخیمی سلول‌های ایمنی (CTCL) پس از درمانِ ایمونوتراپی با سلول های CAR-T دریافت کرده است. در پی این رخدادها، طبق نظر FDA بیمارانی که این درمان ها را دریافت می کنند باید مادام العمر تحت نظر باشند. با وجود خطر یاد شده، کارشناسان بر این باورند که مزایای درمان‌های CAR-T بر خطرات آن بیشتر است و این هشدار توسعه‌دهندگان این درمان را مجبور به تولید رده‌های ایمن‌تر می‌کند. این هشدار هنوز تولیدکنندگان CAR-T cell را با چالش جدی مواجه نساخته است. 🙏تهیه مطلب: شایان آقاجانی دانشجو کارشناسی ارشد سلول‌های بنیادی پژوهشگاه رویان 🔗لینک خبر: https://www.cnn.com/2024/01/24/health/fda-car-t-therapies-secondary-cancer-risk/index.html Join us: 🆔 @MolBioMed 🆔 @pluricancer ☝️☝️☝️☝️☝️☝️

اصلاحات RNA و نقش آن در مدل‌های بیماری @MolBioMed اصلاحات آر ان ای (RNA modification) تغییرات شیمیایی پویا و برگشت پذیر روی RNA هستند که در تنظیم پایداری، ترجمه و محلی سازی mRNA موثر هستند. اصلاحات RNA، توسط سیستم "نوشتن-پاک کردن-خواندن"(writing-erasing-reading) انجام می‌شود که متشکل از آنزیم های اصلاح کننده RNA مختلف است که به عنوان "نویسنده"، "پاک کن" و "خواننده" عمل می کنند. در یک فرآیند کامل اصلاح RNA، "نویسنده" اصلاحات RNA را روی بسترهای RNA نصب می کند. "پاک کن" علائم شیمیایی نصب شده روی RNA را حذف می کند. "خواننده" تغییرات RNA را تشخیص می دهد و به سمت هدف هدایت می‌کند. اصلاحات رایج RNA، از جمله ویرایش m6A، m5C، m1A، m7G، که از نوع متیلاسیون RNA و ویرایش Ψ و A-to-I که ویرایش خود RNA هستند از اصلاحات رایج شمرده می‌شوند. در این مطالعه همچنین به یک اصلاح جدید RNA به نام ac4C اشاره شده که توسط NAT10 نصب و احتمالاً توسط SIRT7 حذف می‌شود. بر اساس سیستم تنظیمی اصلاح آر ان ای دانشمندان Qiu و Jing در یک مطالعه مروری به طور جامع دخالت عملکردی هفت اصلاح RNA را در پنج مدل بیماری انسانی، از جمله سرطان، اختلالات عصبی، بیماری های قلبی عروقی، اختلالات متابولیک، و همچنین بیماری های ژنتیکی و رشد بررسی کردند. به عنوان مثال، اصلاح کننده‌های"نویسنده" یعنی METTL3وMETTL14 که اصلاح m6A را انجام می‌دهند، هر دو نقش انکوژنیک و سرکوب کننده تومور را بسته به رونوشت هدف و مدل بیماری نشان می‌دهند. نقایص ژنتیکی مادرزادی و نقایص رشد می‌تواند حاصل جهش در «نویسندگانِ» m5C، باشد که می‌تواند بیماری هایی مانند سندرم کری دو چت (NSUN1) و سندرم دوبوویتز (NSUN2) را به همراه داشته باشد. و یا از طرفی متیل ترانسفراز METTL1 که اصلاح m7G را انجام می‌دهد، می‌تواند باعث بهبود جریان خون در بیماری های قلبی عروقی شود. مهمتر از همه، در این مطالعه بسیاری از کوچک مولکول‌های مهارکننده‌ موجود را که اصلاح‌کننده‌های مختلف RNA را هدف قرار می‌دهند، همراه با توضیح مکانیسم‌های عمل آنها فهرست شده است. به طور کلی، بیشتر مهارکننده‌ها در برابر متیلاسیون RNA ساخته شده‌اند، به‌ویژه آن‌هایی که به طور خاص آنزیم‌های اصلاح‌کننده m6A مانند METTL3 و FTO را هدف قرار می‌دهند. در این مطالعه Qiu و Jing بر اساس درک کامل و خلاصه‌ای از مکانیسم‌های تغییرات RNA، نقش آن‌ها در مدل‌های بیماری، و نقش کوچک مولکول‌ها و همچنین بینش‌های جدیدی در مورد جهت‌گیری‌های آینده تحقیقات در زمینه اصلاح RNA ارائه کردند. این بررسی جامع برای توسعه استراتژی‌های درمانی جدید با هدف اصلاح RNA مفید است. 🙏🏻 تهیه مطلب: شایان آقاجانی دانشجوی کارشناسی ارشد سلول‌های بنیادی 🔗لینک خبر: https://phys.org/news/2023-09-rna-modification-mechanisms-therapeutic.html 🔗لینک مقاله: https://link.springer.com/article/10.1186/s43556-023-00139-x Join us: 🆔 @MolBioMed 🆔 @RNA_Biology ☝️☝️☝️☝️☝️☝️

🧬 ارائه‌ی یک رویکرد #فردمحور برای #تشخیص_سرطان_تخمدان در مطالعه‌ای که در مجله‌ی Gynecologic Oncology به تازگی منتشر شده است، یک رویکرد مبتنی بر هوش مصنوعی (machine learning, ML) برای تشخیص #دقیق و #زودهنگام سرطان تخمدان با استفاده از #پروفایل‌های_متابولومیکِ خون افراد مبتلا به سرطان تخمدان ارائه شده است. در این مقاله، نمونه‌های سرمی از ۴۳۱ بیمار مبتلا به #سرطان_تخمدان و ۱۳۳ نمونه فرد سالم از ۴ مکان متفاوت در کانادا و آمریکا جمع‌آوری و با روش کروماتوگرافی مایع و طیف سنجی جرمی (UPLC-MS/MS) مورد ارزیابی قرار گرفتند. از مجموع نتایج حاصله، بهترین پیش‌بینی‌ از هر پروفایل متابولیک با توزیع فراوانی (Frequency Distribution) هر بیمار انتخاب شدند به طوری که بتواند نمونه‌های سرطانی را از نمونه‌های کنترل با #دقت_۹۳_درصد متمایز کند. این رویکرد از نظر بالینی #دقیق‌تر است و همچنین اطلاعات بیشتری نسبت به تست‌های سنتی می‌دهد و می‌تواند به عنوان یک روش جدید امیدوارکننده در تشخیص زودهنگام #سرطان_تخمدان به کار برود. ✍️ کیمیا حسنیان باتقوی، دانشجوی ارشد سلول‌های بنیادی و بازسازی بافت پژوهشگاه رویان لینک مقاله: https://www.gynecologiconcology-online.net/article/S0090-8258(23)01636-0/fulltext Join us: 🆔 @pluricancer 🆔 @MolBioMed

🧬 شرکت #میراث با ارائه فهرست جامعی از محصولات و خدمات خود در حوزه #الیگونوکلئوتیدها، فردا و پس فردا در حاشیه کنفرانس بین‌المللی سرطان رویان در خدمت اساتید و پژوهشگران عزیز خواهد بود. 🧬در حاشیه کنفرانس #سرطان به غرفه ما سر بزنید. Join us: 🆔 @miRasBiotech

🟢 ارائه یک روش کارامد جهت تشخیص سلول‌های بنیادی عصبی خفته از حالت فعال ❓ #سلول‌های_بنیادی_عصبی (NSCs) جهت تولید سلول‌های عصبی باید از حالت خفته خارج شوند؛ اما به دلیل محدودیت‌ در فناوری‌های فعلی، محققان درک محدودی از این فرایند دارند. ✔️ محققان در مقاله‌ای که به تازگی در مجله Cell Stem Cell منتشر شده است، متوجه شدند که NSCهای خفته به دلیل داشتن زیر مجموعه‌ای از لیزوزوم‌ها، پروفایل‌ #اتوفلورسانس منحصر به فرد و متمایزی از NSCهای فعال دارند. این خاصیت اتوفلورسانس مربوط به #کوفاکتورهای_متابولیکی است که تغییر متابولیک سلول، سبب تغییر در خواص نوری فلوروفورهای درون‌زاد آن می‌شود. در این مطالعه با همراه کردن تصویربرداری اتوفلورسانس با تکنیک توالی‌یابی RNA تک سلولی (scRNA-seq)، منابعی ایجاد کردند که ویژگی‌های رونویسی حالت خفته‌‌ی عمیق و فعال‌شدن سریع NSCها را نشان‌ می‌دهد. روش اتوفلورسانس به دلیل اینکه سلول را بدون نشاندار کردن، در حالت زنده و بدون ایجاد اختلالی در آن ردیابی می‌کند، حائز اهمیت بوده و تاکنون در انواع سلول‌های دیگری نیز جهت مطالعه‌ی حالات مختلف سلولی ناشی از تغییرات متابولیک، استفاده شده است. ✍ ملیکا زمانیان، دانشجوی دکترای علوم سلولی کاربردی پژوهشگاه رویان 🖇 لینک مقاله: https://www.cell.com/cell-stem-cell/abstract/S1934-5909(24)00054-7?dgcid=raven_jbs_aip_email Join us: 🆔 @pluricancer 🆔 @MolBioMed

ارزیابی وضعیت تمایز نیافتگی سلول‌های iPS انسانی با استفاده از پلتفرم تجزیه و تحلیل محیط کشت سلولی ™C2MAP @MolBioMed 🔰توسعه فن آوری برای تهیه و عرضه سلول های iPS در کیفیت بالا و مقادیر زیاد یک نیاز اساسی برای تجاری سازی پزشکی بازساختی می‌باشد. به طور رایج از تکنیک های دستی مانند تجزیه و تحلیل بیان ژن برای ارزیابی وضعیت تمایز سلولی استفاده می شود اما این روش جزء روش‌های تهاجمی محسوب شده و باعث اختلال در نتایج بدست آمده از سلول می‌شوند. در این خبر به پلت فرم تجزیه و تحلیل محیط کشت سلولی C2MAP اشاره شده که با استفاده از کروماتوگرافی مایع-طیف‌سنجی جرمی متوالی(LC-MS/MS) برای ایجاد یک روش غیرتهاجمی برای ارزیابی وضعیت سلول از طریق تجزیه و تحلیل اجزای رویی کشت سلولی(supernatant) اقدام نمودند. 📉برای شروع مطالعه با استفاده نرم افزار مولتی اومیکس Shimadzu Multi-omics Analysis Gadget Pack تعداد 95 بیومارکر متابولیکی به عنوان کاندیدا در بررسی سطح تمایز نیافتگی(پرتوانی) سلول‌های ips انتخاب گردید. 🔸سلول‌های ips رده (PFX#9 line) به مدت 6 روز در محیط کشت TeSR™-E8™کشت داده شدند که در هر 24 ساعت تعویض محیط صورت می‌گرفت و سوپرناتانت آن برای تجزیه و تحلیل جمع آوری می‌گردید. 🔹دستگاه C2MAP توانست 55 تا از 95 بیومارکر انتخابی شناسایی کند. با بررسی سطح زیر نمودار از نمونه‌های سوپرناتانت ips های نگه داشته شده در حالت تمایز نیافته و سه رده زایا و مقایسه‌ی آن‌ها با یکدیگر، یکی از متابولیت‌های اسیدآمینه تریپتوفان به نام kynurenine، به عنوان بیومارکر در سوپرناتانت سلول‌های ips تمایز نیافته، تفاوت جدی را از خود نشان داد. همچنین 2-aminoadipic acid که از متابولیت‌های اسیدآمینه لیزین می‌باشد، به عنوان بیومارکر شاخص در رده زایای اکتودرمی شناسایی شد. 🔻متابولیت kynurenine قادر است با فاکتور رونویسیِ زنوبیوتیک Aryl-hydrocarbon Receptor (AhR) کمپلکس Kyn-AhR را ایجاد کند که می‌تواند وارد هسته شود و بیان ژن‌های (POU5F1, NANOG, EP300) را افزایش دهد و به حفظ پرتوانی سلول و خودنوزایی آن کمک کند. 🔻و اما در مورد 2-aminoadipic acid که به عنوان بیومارکر اکتودرمی شناسایی شد، با اضافه کرن سرکوب گر KAT2، از آنزیم‌های مطرح شده در تشکیل اکتودرم، دیدند که میزان تشکیل 2-aminoadipic acid در سلول و همچنین تشکیل اکتودرم نیز به شدت کاهش پیدا کرد. 📣در ادامه دو مسیر اصلی در تشکیل 2-aminoadipic acid را بررسی کردندد؛ یکی مسیر لیزین و دیگری مسیر kynurenine؛ همانطور که گفته شد kynurenine به عنوان یک فاکتور ضروری در حفظ پرتوانی ips معرفی شد، اما در ادامه، برای تشکیل رده زایای اکتودرمی، سلول به آن نیاز دارد. از این مطالعه این چنین استنباط می‌شود که تولید 2-aminoadipic acid در سلول از طریق مسیر kynurenine صورت می‌گیرد زیرا: 1- مقدار لیزین در این مدت ثابت باقی ماند 2- با اضافه کرد فاکتورهای رشد اکتودرمی مسیر تجزیه kynurenine فعال شد 📋 تهیه مطلب: شایان آقاجانی دانشجوی کارشناسی ارشد سلول‌های‌بنیادی، پژوهشگاه رویان لینک خبر: https://www.shimadzu.com/an/literature/lcms/jpo120025.html Join us: 🆔 @MolBioMed 🆔 @RNA_Biology ☝️☝️☝️☝️☝️☝️

شکست و ترمیم DNA و نقش آن در حافظه در هنگام شکل گیری حافظه بلند مدت، برخی از سلول‌های مغز فعالیت‌های الکتریکی شدیدی را تجربه می‌کنند که به دلیل شدت آن می‌تواند به DNA آسیب برساند و باعث شکسته شدن قطعاتی از DNA شود. اخیرا مطالعه روی موش ها که نتایج آن در مجله nature چاپ نشان داد که این شکست DNA یک پاسخ التهابی را برای ترمیم DNA آغار می‌کند می‌کند که به تقویت حافظه کمک می‌کند. 🔹لی-هوی تسای، عصب‌-بیولوژیست در مؤسسه فناوری ماساچوست در کمبریج که در این پروژه حضور نداشت، می‌گوید این یافته‌ها که در 27 مارس در Nature منتشر شد، «بسیار هیجان‌انگیز» هستند. او می‌گوید، آن‌ها این تضور را به وجود آورده‌‌اند که شکل‌دهی خاطرات یک «کسب و کار خطرناک» است. به طور معمول، شکستگی در هر دو رشته مولکول DNA مارپیچ دوگانه با بیماری هایی از جمله سرطان مرتبط است. اما در این مورد، چرخه آسیب و ترمیم DNA یک توضیح برای چگونگی شکل گیری و ماندگاری خاطرات ارائه می دهد. 🔹جلنا رادولوویچ، یکی از نویسندگان این مطالعه، متخصص علوم اعصاب در کالج پزشکی آلبرت انیشتین می‌گوید: این چرخه ممکن است در افراد مبتلا به بیماری‌های عصبی مانند آلزایمر به درستی کار نکند و باعث ایجاد خطا در DNA یک نورون شود. 💬این اولین بار نیست که آسیب DNA با حافظه مرتبط می شود. در سال 2021، تسای و همکارانش نشان دادند که شکست های DNA دو رشته ای در مغز به طور معمول وجود دارد که با یادگیری نیز مرتبط است. 🔹رادولوویچ و همکارانش برای درک بهتر نقش شکست‌های DNA در شکل‌گیری حافظه، موش‌ها را آموزش دادند تا یک شوک الکتریکی کوچک را با یک محیط جدید مرتبط کنند، به طوری که وقتی این موش‌ها مجددا در آن محیط قرار گرفتند، این تجربه را به خاطر بسپارند که باعث می‌شد علائم ترس مانند بی‌حرکت ماندن در جای خود را نشان دهند. سپس محققان فعالیت ژنی را در نورون‌ها در ناحیه اصلی مرتبط با حافظه در مغز یعنی هیپوکامپ بررسی کردند. آنها دریافتند که برخی از ژن های مسئول التهاب چهار روز پس از شروع آزمایش در مجموعه ای از نورون ها فعال هستند. سه هفته بعد از تمرین، همان ژن‌ها بسیار کمتر فعال بودند. 💭این تیم علت التهاب را چنین مشخص کرد: پروتئینی به نام TLR9، که پاسخ ایمنی به قطعات DNA شناور در داخل سلول ها را فعال می کند. رادولوویچ می‌گوید: این پاسخ التهابی شبیه به واکنشی است که سلول‌های ایمنی هنگام دفاع در برابر مواد ژنتیکی در برابر عوامل بیماری‌زای مهاجم از آن استفاده می‌کنند. با این حال، در این مورد، سلول‌های عصبی نه به مهاجمان، بلکه به DNA خود پاسخ می‌دهند. 🔹ژن TLR9 در نورون‌هایی که در برابر ترمیم شکسته شدن DNA مقاومت می‌کند، فعال‌تر بود. در این سلول ها، ماشین آلات ترمیم DNA در اندامکی به نام سانتروزوم تجمع می یابد که اغلب با تقسیم و تمایز سلولی همراه است. رادولوویچ می‌گوید، با وجود اینکه، نورون‌های بالغ قابلیت تقسیم ندارند، دیدن سانتروزوم‌هایی که در ترمیم DNA شرکت می‌کنند شگفت‌انگیز است. او از خود می‌پرسد که آیا خاطرات از طریق مکانیسمی شکل می‌گیرند که شبیه نحوه هماهنگی سلول‌های ایمنی با مواد خارجی است که با آن مواجه می‌شوند. وی می‌گوید: به عبارت دیگر، در طول چرخه‌های آسیب و ترمیم، نورون‌ها ممکن است اطلاعات مربوط به رویداد تشکیل حافظه را که باعث شکسته شدن DNA شده است را رمزگذاری کنند. 🔹هنگامی که محققان ژن کد کننده پروتئین TLR9 را از موش ها حذف کردند، آن‌ها در به خاطر آوردن خاطرات طولانی مدت مربوط به آموزش خود با مشکل مواجه شدند؛ زمانی که در محیطی قرار می گرفتند که قبلاً در آن دچار شوک الکتریکی شده بودند، نسبت به موش هایی که ژن آن‌ها دستکاری نشده بود، خیلی کمتر علامت بی‌حرکت ماندن در جای خود را بروز می‌دادند. رادولوویچ می‌گوید: این یافته‌ها نشان می‌دهد که «ما از DNA خود به‌عنوان یک سیستم سیگنالینگ استفاده می‌کنیم» تا «اطلاعات را برای مدت طولانی حفظ کنیم». 🔹اینکه چگونه یافته های این تیم با سایر اکتشافات در مورد شکل گیری حافظه مطابقت دارد هنوز مشخص نیست. برای مثال، در گذشته محققان مجموعه‌ای از نورون‌ها را کشف کردن که درهیپوکامپ در هنگام تشکیل حافظه دچار تغییرات بیوشیمی و فیزیکی می‌گردد و این شبکه نورونی را engram نامیدند که ژن های خاصی را پس از یک رویداد یادگیری بیان می کنند. اما برخی معتقدند، گروهی از نورون‌ها که رادولوویچ و همکارانش التهاب مرتبط با حافظه را در آن مشاهده کردند، عمدتاً با نورون‌های engram متفاوت هستند. 🔹توماس رایان، عصب‌شناس در کالج ترینیتی دوبلین، می‌گوید « این مطالعه تا کنون بهترین شواهدی را ارائه می‌کند که ترمیم DNA برای حافظه مهم است». اما او می‌پرسد که آیا این نورون‌ها چیزی متمایز از engram را رمزگذاری می‌کنند یا خیر - در عوض، او می‌گوید، آسیب و ترمیم DNA می‌تواند نتیجه ایجاد engram باشد.

کلارا اورتگا عصب‌شناس می‌گوید: ما چیزهای زیادی در مورد اتصال بین نورون‌ها و انعطاف‌پذیری عصبی می‌دانیم، اما در مورد آنچه در داخل نورون‌ها اتفاق می‌افتد، اطلاعات زیادی نداریم. 📋 تهیه مطلب: شایان آقاجانی دانشجوی کارشناسی ارشد سلول‌های‌بنیادی، پژوهشگاه رویان لینک خبر: https://www.nature.com/articles/d41586-024-00930-y Join us: 🆔 @MolBioMed 🆔 @RNA_Biology ☝️☝️☝️☝️☝️☝️

🧬 درمان بیماری ارثی کبدی با #ژن‌_درمانی ❓ کمبود آنزیم آرژنینوسوکسینات لیاز (ASLD) یک اختلال متابولیک مغلوب است. این آنزیم در یکی از مراحل ضروری سنتز اوره، آرژنینوسوکسینات (ASA، نشانگر زیستی ASLD) را تجزیه می‌کند. کمبود این آنزیم، منجر به تجمع بسیار خطرناک آرژنینوسوکسینیک اسید و آمونیاک می‌شود. آمونیاک اضافی باعث اختلال در هوشیاری، کما و حتی مرگ می‌شود. درمان‌های فعلی شامل رژیم غذایی کم‌پروتئین، مکمل‌های آرژنین، حذف نیتروژن و در برخی موارد پیوند کبد است که رضایت‌بخش نیستند. ✅ محققان در مطالعه‌ای که به تازگی منتشر شده است، سلول‌های فیبروبلاست پوست این بیماران را به #سلول‌های_بنیادی_پرتوان_القایی (iPSCs) تبدیل کردند، متعابا با سیستم #کریسپر بر پایه‌ی ویرایشگرهای بازی آدنین (ABEs) نقص ژنتیکی در این آنزیم را ویرایش کردند. سپس این #سلول‌های_بنیادی ویرایش شده را به سلول‌های شبه هپاتوسیت تمایز دادند. نتایج نشان دهنده‌ی کاهش 1000 برابری در سطوح آرژنینوسوکسینات در سلول‌ها در مقایسه با سلول‌های ویرایش‌نشده بود. ✴️ این رویکرد که روش کارامدی جهت ویرایش دقیق آرژنینوسوکسینات لیاز و بازیابی عملکرد چرخه اوره ارائه می‌دهد، به دلیل استفاده از #نانوذرات_لیپیدی که با رویکردهای بالینی سازگار است، استفاده بالینی آن را در آینده تسهیل می‌کند. ✍ ملیکا زمانیان، دانشجوی دکترای علوم سلولی کاربردی پژوهشگاه رویان مطالعه بیشتر👇👇👇 https://www.cell.com/ajhg/fulltext/S0002-9297(24)00077-6#%20 Join us: 🆔 @pluricancer 🆔 @MolBioMed