هدایت شده از جوان انقلابی
اسماعیل هنیه فعالیت سیاسی خود را در «حزب اسلامی» در نوار غزه که نماینده شاخه دانشجویی اخوان المسلمین بود و جنبش مقاومت اسلامی از آن شکل گرفت، آغاز کرد. وی بین سال های ۱۹۸۳ تا ۱۹۸۴ به عنوان عضو شورای دانشجویی دانشگاه اسلامی غزه مشغول به کار شد و سپس در سال بعد سمت ریاست شورای دانشجویی را بر عهده گرفت. هنیه در سال ۱۹۸۹ به مدت سه سال توسط مقامات رژیم اشغالگر اسرائیل اسیر و پس از آن به همراه گروهی از رهبران حماس به منطقه «مرج الزهور» واقع در مرز فلسطین و لبنان تبعید شد. وی پس از گذراندن یک سال تبعید به غزه بازگشت و به ریاست دانشگاه اسلامی آنجا منصوب شد و در سال ۱۹۹۷ پس از آزادی، «شیخ احمد یاسین» ‌ بنیانگذار حماس وی را به عنوان رئیس دفتر خود در نوار غزه انتخاب شد. در دسامبر ۲۰۰۵، هنیه در صدر فهرست انتخاباتی «تغییر و اصلاح» قرار داشت که در دومین انتخابات پارلمانی فلسطین در سال ۲۰۰۶ اکثریت کرسی ها را به دست آورد. جنبش حماس در ۱۶ فوریه ۲۰۰۶ اسماعیل هنیه را برای تصدی پست نخست وزیری فلسطین معرفی کرد و در ۲۰ همان ماه منصوب شد. او در ماه مه ۲۰۱۷ به عنوان رئیس دفتر سیاسی جنبش حماس و جانشین خالد مشعل انتخاب شد. اسماعیل هنیه چندین بار مورد سوءقصد قرار گرفت که پیش از تهران، آخرین آن در سال ۲۰۰۳ و زمانی بود که جنگنده های رژیم اسرائیل در پی عملیات شهادت طلبانه گردان های شهید عزالدین القسام شاخه نظامی جنبش حماس، گروهی از رهبران مقاومت را هدف قرار دادند.