آیت الله سیدجواد خامنه‌ای در ۱۵ تیر ۱۳۶۵ درگذشت. شیخ ابوالحسن شیرازی امام جمعهٔ مشهد، بر او نماز گزارد و در رواق پشت ضریح علی بن موسی الرضا، جنب دارالفیض به خاک سپرده شد. در پی درگذشت آیت الله سید جواد خامنه‌ای،امام خمینی در پیامی ضمن تسلیت به فرزند بزرگوار وی (آیت الله سیدعلی خامنه‌ای) بیان کرد: جناب حجت‌الاسلام آقای حاج سید علی خامنه‌ای رئیس‌جمهور محترم دامت افاضاته، رحلت والد معظم جنابعالی که عمری با علم و تعهد و تقوا به سر بردند، موجب تأسف گردید. این مصیبت را به جنابعالی و اخوان محترم و خاندان جلیل تسلی گفته، سلامت و موفقیت آن جناب را از خدای تعالی مسئلت دارم. پانزدهم تیرماه مصادف است با رحلت آیت الله سید جواد خامنه ای شادی روح این بزرگوار صلوات #معاونت_فرهنگی_موسسه_بزرگ #دارالقران_اهل_بیت_علیهم_السلام @ahlobeit313 🌴🌴🌴🌴🌴 @patoogh313 🌴🌴🌴🌴🌴 www.ahlobeit.com