مهدی، پسر کوچک‌تر مسعود پزشکیان در دانشگاه در مقطع کارشناسی و کارشناسی ارشد در رشته برق تحصیل کرده و هم اکنون در مقطع دکتری (PHD)، ظاهرا به شکل بورسیه خارج، در حال تحصیل است. همسر وی، فاطمه کار‌شناسی ارشد حقوق دارد و دارای یک فرزند با نام محمدحسین» هستند.