خواص دعای یَاعَلِیُّ یَاعَظِیمُ از جمله دعاهایی است که از مضامین و محتوای بسیار بلندی برخوردار است. سید بن طاووس از امام صادق 'ع' و امام کاظم 'ع' روایت کرده است که فرمودند: از اول ماه تا آخر ماه مبارک بعد از هر نماز فریضه‏ای، آن دعای شریف زمزمه شود. این دعا می‌تواند اثراتی از جهت خداشناسی، شناخت ماه رمضان، شناخت قرآن، شناخت شبِ قدر، و آداب دعا کردن در انسان بگذارد.