رهبر حکیم انقلاب حدود دو سال پس از روی کار آمدن دولت آقای روحانی(خرداد ۱۳۹۴)، خاطره‌ای از اختلاف عمده امام خمینی و دولت موقت به محوریت مهندس بازرگان نقل می‌کنند که بسیار جالب توجه است. ایشان می‌فرمایند"اختلاف عمده دولت موقت با امام بزرگوار سر این قضیه بود که آنها توجه نمی‌کردند که آمریکا تغذیه کننده رژیم طاغوت بود. این رژیم حالا برافتاده است اما آن دستگاه تغذیه کننده هنوز باقی است، فعال است، اگر به او میدان داده شود و مجال داده شود دوباره مشغول خواهد شد و ضربه خواهد زد و نقاط ضعف را جستجو کرده و از آن وارد خواهد شد". گرایش اعضای دولت موقت به غرب و تفکر غربی امر پنهانی نبود. تیر ۵۸، انجمن‌های اسلامی دانشجویان در اروپا طی نامه‌ای سرگشاده به دولت موقت، از این گرایشات به شدت انتقاد کرده و از جمله نوشتند "سخنگوی دولت آقای امیرانتظام در هر یک از مصاحبه‌های مطبوعاتی‌اش کاری جز دلداری غرب نمی‌کند". اما مسئله صرفا به گرایش فکری و دلداری در اظهارات علنی محدود نشد. پس از تصویب اصل ولایت فقیه در مجلس خبرگان قانون اساسی، امیرانتظام طرحی برای انحلال این مجلس تدارک دید و برای تصویب روی میز هیئت دولت گذاشت که با هوشیاری آیت‌الله خامنه‌ای ناکام ماند. دوازدهم آبان ۵۸ مهندس بازرگان نخست وزیر دولت موقت به صورت محرمانه و بدون اطلاع امام، در الجزایر با زبیگنیو برژینسکی ملاقات کرد. روز بعد، دانشجویان لانه جاسوسی آمریکا در تهران را تسخیر کردند. ۱۴ آبان ۵۸، دولت بازرگان استعفا کرد و امام روز بعد این استعفا را قبول کردند. اسناد لانه جاسوسی نشان داد امیرانتظام در حال جاسوسی برای سازمان سیا بوده است. @syjebraily